La Junta Directiva de Aldeas Infantiles SOS Costa Rica es electa cada tres años por medio de la Asamblea General. Tiene la misión de regir a la Asociación Miembro, por lo que se le atribuyen facultades para la revisión, aprobación y toma de decisiones sobre las distintas acciones para el desarrollo y buen desempeño de la organización.
Para el periodo 2019-2022, la Junta Directiva de AISOS está compuesta por:
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